13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4268 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4268  hypothetical protein  100 
 
 
339 aa  643    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00149177  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0578  hypothetical protein  36.52 
 
 
336 aa  165  8e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1829  hypothetical protein  34.67 
 
 
346 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2328  hypothetical protein  33.93 
 
 
435 aa  138  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.634009  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2931  hypothetical protein  34.64 
 
 
327 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1149  hypothetical protein  36.42 
 
 
481 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0978  hypothetical protein  30.37 
 
 
311 aa  101  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.608417  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3097  hypothetical protein  31.1 
 
 
360 aa  84  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.366392  normal  0.158461 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0977  hypothetical protein  29.76 
 
 
307 aa  83.6  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0183973  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4632  hypothetical protein  27.89 
 
 
366 aa  73.6  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1949  hypothetical protein  28.93 
 
 
340 aa  67  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0831325  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1476  hypothetical protein  26.18 
 
 
316 aa  60.1  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1526  hypothetical protein  41.94 
 
 
365 aa  48.5  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.978056  normal  0.147398 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>