13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2931 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012028  Hlac_2931  hypothetical protein  100 
 
 
327 aa  629  1e-179  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1829  hypothetical protein  36.44 
 
 
346 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2328  hypothetical protein  34.41 
 
 
435 aa  156  4e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.634009  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0578  hypothetical protein  36.53 
 
 
336 aa  150  3e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4268  hypothetical protein  33.43 
 
 
339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00149177  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0978  hypothetical protein  33.12 
 
 
311 aa  123  4e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.608417  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1149  hypothetical protein  33.96 
 
 
481 aa  114  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0977  hypothetical protein  30.19 
 
 
307 aa  102  7e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0183973  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3097  hypothetical protein  29.96 
 
 
360 aa  85.9  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.366392  normal  0.158461 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1526  hypothetical protein  30.69 
 
 
365 aa  72.4  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.978056  normal  0.147398 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4632  hypothetical protein  25.15 
 
 
366 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1476  hypothetical protein  25 
 
 
316 aa  63.9  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1949  hypothetical protein  22.95 
 
 
340 aa  50.8  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0831325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>