24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1833 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1833  acyltransferase 3  100 
 
 
371 aa  733    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4900  hypothetical protein  55.74 
 
 
146 aa  114  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.188335  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0110  hypothetical protein  28.74 
 
 
346 aa  99.4  8e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000948  fucose 4-O-acetylase  26.11 
 
 
341 aa  94.4  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3266  acyltransferase 3  30.19 
 
 
349 aa  81.3  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06990  hypothetical protein  26.88 
 
 
341 aa  77.8  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0718  membrane protein  28.97 
 
 
341 aa  72.4  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.145358  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3884  acyltransferase family protein  37.88 
 
 
331 aa  44.7  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2616  acyltransferase 3  30.94 
 
 
303 aa  44.3  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4057  acyltransferase family protein  37.88 
 
 
331 aa  44.3  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3764  acyltransferase family protein  37.88 
 
 
331 aa  44.3  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.748321  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4108  putative acyltransferase  37.84 
 
 
330 aa  44.3  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0149  acyltransferase 3  37.88 
 
 
331 aa  44.3  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4169  hypothetical protein  37.84 
 
 
330 aa  44.3  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273033 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0050  acyltransferase 3  37.84 
 
 
330 aa  44.3  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.490753  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0153  acyltransferase 3  37.88 
 
 
331 aa  44.3  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73773  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03413  conserved inner membrane protein  37.88 
 
 
331 aa  44.3  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4937  acyltransferase family protein  37.88 
 
 
331 aa  44.3  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.125366 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03364  hypothetical protein  37.88 
 
 
331 aa  44.3  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1004  putative serine/alanine racemase VanTc3  29.9 
 
 
318 aa  43.1  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6044  Serine/alanine racemase VanTc3  29.9 
 
 
318 aa  43.1  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4291  acyltransferase 3  24.12 
 
 
380 aa  43.1  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.625085  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3853  acyltransferase 3  36.11 
 
 
331 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3872  acyltransferase 3  36.11 
 
 
331 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>