14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0110 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_0110  hypothetical protein  100 
 
 
346 aa  697    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000948  fucose 4-O-acetylase  56.6 
 
 
341 aa  401  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06990  hypothetical protein  57.77 
 
 
341 aa  385  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0718  membrane protein  52.2 
 
 
341 aa  333  3e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.145358  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1833  acyltransferase 3  28.74 
 
 
371 aa  85.5  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3266  acyltransferase 3  26.23 
 
 
349 aa  66.2  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3981  acyltransferase 3  24.1 
 
 
331 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3872  acyltransferase 3  24.1 
 
 
331 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3935  acyltransferase 3  24.1 
 
 
331 aa  46.6  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.876763 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4040  acyltransferase 3  24.1 
 
 
331 aa  46.6  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.058021 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3853  acyltransferase 3  24.1 
 
 
331 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0160  acyltransferase 3  28.21 
 
 
331 aa  45.4  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2465  acyltransferase 3  31 
 
 
362 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3884  acyltransferase family protein  29.45 
 
 
331 aa  43.5  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>