14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0663 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0663  protein of unknown function DUF1328  100 
 
 
91 aa  176  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2089  protein of unknown function DUF1328  54.29 
 
 
76 aa  69.7  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0321918 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2660  protein of unknown function DUF1328  76.92 
 
 
68 aa  65.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0049  hypothetical protein  62.75 
 
 
53 aa  58.2  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2216  hypothetical protein  54.55 
 
 
51 aa  48.5  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3110  hypothetical protein  54.35 
 
 
55 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0093  hypothetical protein  42.55 
 
 
97 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03948  hypothetical protein  46.67 
 
 
52 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0172  hypothetical protein  46.67 
 
 
51 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2074  protein of unknown function DUF1328  56.14 
 
 
69 aa  41.6  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.180702  normal  0.141767 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0056  hypothetical protein  42.55 
 
 
58 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.397511 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2080  hypothetical protein  40 
 
 
77 aa  40.8  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5993  hypothetical protein  44.44 
 
 
54 aa  40.8  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0245  protein of unknown function DUF1328  44.9 
 
 
57 aa  40.4  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0548817 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>