11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2089 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2089  protein of unknown function DUF1328  100 
 
 		 76 aa  142  1e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0321918 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0049  hypothetical protein  68.63 
 
 		 53 aa  68.6  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2216  hypothetical protein  70 
 
 		 51 aa  67  0.00000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2074  protein of unknown function DUF1328  65.52 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.180702  normal  0.141767 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0172  hypothetical protein  56.52 
 
 		 51 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0663  protein of unknown function DUF1328  54.29 
 
 		 91 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03948  hypothetical protein  52.17 
 
 		 52 aa  44.3  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0322  hypothetical protein  55.56 
 
 		 51 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.934332 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2660  protein of unknown function DUF1328  56.67 
 
 		 68 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0320  hypothetical protein  62.5 
 
 		 51 aa  41.2  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.908669 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0093  hypothetical protein  40.82 
 
 		 97 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>