14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2074 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2074  protein of unknown function DUF1328  100 
 
 		 69 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.180702  normal  0.141767 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2089  protein of unknown function DUF1328  65.52 
 
 		 76 aa  77  0.00000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0321918 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2216  hypothetical protein  73.47 
 
 		 51 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0049  hypothetical protein  68.63 
 
 		 53 aa  68.9  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0322  hypothetical protein  75.51 
 
 		 51 aa  54.3  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.934332 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0320  hypothetical protein  77.08 
 
 		 51 aa  51.2  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.908669 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1807  hypothetical protein  47.92 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0093  hypothetical protein  37.5 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3511  hypothetical protein  56.82 
 
 		 54 aa  42.7  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2834  hypothetical protein  56.82 
 
 		 54 aa  42.7  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.397287  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3864  hypothetical protein  54.55 
 
 		 54 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.231517  normal  0.991686 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0663  protein of unknown function DUF1328  49.25 
 
 		 91 aa  40.4  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0080  hypothetical protein  47.73 
 
 		 54 aa  40  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4110  hypothetical protein  53.49 
 
 		 54 aa  40  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>