27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1897 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1897  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  526  1e-148  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.511504  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0993  hypothetical protein  34.55 
 
 
251 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.942537  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0936  hypothetical protein  34.15 
 
 
251 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.419127  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0996  hypothetical protein  41.32 
 
 
249 aa  75.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.370727  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0977  hypothetical protein  33.16 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218555  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1931  hypothetical protein  30.83 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.682348  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1479  hypothetical protein  29.37 
 
 
381 aa  65.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1574  hypothetical protein  29.37 
 
 
381 aa  65.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.183667  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1983  hypothetical protein  27.35 
 
 
267 aa  65.1  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0673397  normal  0.275801 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1482  hypothetical protein  29.92 
 
 
380 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.6369 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2385  hypothetical protein  28.57 
 
 
381 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.126632  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1321  hypothetical protein  29.91 
 
 
306 aa  62.4  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.879322  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0069  hypothetical protein  35.79 
 
 
371 aa  60.8  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.568066  normal  0.0454782 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2813  hypothetical protein  25 
 
 
303 aa  58.9  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0176  hypothetical protein  30.77 
 
 
264 aa  54.3  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3337  hypothetical protein  29.13 
 
 
264 aa  53.1  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2316  hypothetical protein  24.79 
 
 
312 aa  52  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000423771  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0658  hypothetical protein  24.79 
 
 
296 aa  50.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0839  hypothetical protein  26.98 
 
 
265 aa  50.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1968  hypothetical protein  24.74 
 
 
316 aa  50.4  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000544563  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1907  hypothetical protein  24.79 
 
 
310 aa  50.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0771362 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4447  hypothetical protein  29.59 
 
 
378 aa  50.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2351  hypothetical protein  22.73 
 
 
300 aa  46.2  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.745775 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2338  hypothetical protein  25.83 
 
 
401 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.458402  normal  0.0784504 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0078  hypothetical protein  32 
 
 
250 aa  44.3  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3425  hypothetical protein  26.19 
 
 
267 aa  43.9  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1227  hypothetical protein  25 
 
 
265 aa  43.5  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000275187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>