22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1321 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1321  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  624  1e-178  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.879322  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0658  hypothetical protein  48.39 
 
 
296 aa  264  2e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1907  hypothetical protein  43.23 
 
 
310 aa  238  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0771362 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2813  hypothetical protein  45.63 
 
 
303 aa  237  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2316  hypothetical protein  43.04 
 
 
312 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000423771  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1983  hypothetical protein  46.27 
 
 
267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0673397  normal  0.275801 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1931  hypothetical protein  45.83 
 
 
257 aa  216  4e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.682348  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1968  hypothetical protein  36.77 
 
 
316 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000544563  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1479  hypothetical protein  37.93 
 
 
381 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2385  hypothetical protein  37.5 
 
 
381 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.126632  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1482  hypothetical protein  36.81 
 
 
380 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.6369 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1574  hypothetical protein  37.24 
 
 
381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.183667  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0069  hypothetical protein  38.21 
 
 
371 aa  100  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.568066  normal  0.0454782 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4447  hypothetical protein  26.79 
 
 
378 aa  85.5  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2338  hypothetical protein  28.17 
 
 
401 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.458402  normal  0.0784504 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1897  hypothetical protein  29.91 
 
 
268 aa  55.8  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.511504  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2351  hypothetical protein  28.32 
 
 
300 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.745775 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0839  hypothetical protein  25 
 
 
265 aa  47.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0176  hypothetical protein  24.76 
 
 
264 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3337  hypothetical protein  26.83 
 
 
264 aa  43.9  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3425  hypothetical protein  25.61 
 
 
267 aa  43.1  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1227  hypothetical protein  22.14 
 
 
265 aa  42.7  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000275187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>