14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0176 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0176  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  520  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3425  hypothetical protein  68.34 
 
 
267 aa  362  4e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0839  hypothetical protein  55.13 
 
 
265 aa  295  6e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3337  hypothetical protein  50.2 
 
 
264 aa  235  6e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1227  hypothetical protein  48.48 
 
 
265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000275187  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0078  hypothetical protein  44.31 
 
 
250 aa  208  8e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2351  hypothetical protein  27.52 
 
 
300 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.745775 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1897  hypothetical protein  30.77 
 
 
268 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.511504  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0996  hypothetical protein  30.7 
 
 
249 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.370727  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0993  hypothetical protein  30.7 
 
 
251 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.942537  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0936  hypothetical protein  30.7 
 
 
251 aa  45.4  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.419127  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1931  hypothetical protein  24.6 
 
 
257 aa  45.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.682348  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1321  hypothetical protein  24.76 
 
 
306 aa  45.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.879322  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1907  hypothetical protein  22.22 
 
 
310 aa  43.5  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0771362 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>