21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1907 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1907  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  627  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0771362 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2316  hypothetical protein  85.26 
 
 
312 aa  485  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000423771  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2813  hypothetical protein  50.5 
 
 
303 aa  282  5.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1931  hypothetical protein  48.69 
 
 
257 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.682348  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1983  hypothetical protein  49.08 
 
 
267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0673397  normal  0.275801 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1321  hypothetical protein  43.23 
 
 
306 aa  229  6e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.879322  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0658  hypothetical protein  42.67 
 
 
296 aa  223  3e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1968  hypothetical protein  36.81 
 
 
316 aa  178  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000544563  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0069  hypothetical protein  49.59 
 
 
371 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.568066  normal  0.0454782 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1482  hypothetical protein  39.1 
 
 
380 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.6369 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1479  hypothetical protein  36.13 
 
 
381 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2385  hypothetical protein  38.62 
 
 
381 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.126632  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1574  hypothetical protein  35.11 
 
 
381 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.183667  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4447  hypothetical protein  38.89 
 
 
378 aa  90.5  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2338  hypothetical protein  30.77 
 
 
401 aa  75.9  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.458402  normal  0.0784504 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2351  hypothetical protein  30.87 
 
 
300 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.745775 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1897  hypothetical protein  24.79 
 
 
268 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.511504  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0936  hypothetical protein  26.37 
 
 
251 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.419127  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0176  hypothetical protein  22.22 
 
 
264 aa  43.5  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0996  hypothetical protein  26.37 
 
 
249 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.370727  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0993  hypothetical protein  26.37 
 
 
251 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.942537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>