11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2418 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2418  protein of unknown function DUF1641  100 
 
 
215 aa  401  1e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.784703 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2081  protein of unknown function DUF1641  54.9 
 
 
226 aa  155  6e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.278227  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4037  protein of unknown function DUF1641  38.07 
 
 
222 aa  109  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.144697  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4118  hypothetical protein  29.2 
 
 
246 aa  68.9  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1437  hypothetical protein  34.78 
 
 
145 aa  57.8  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0867046 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0351  hypothetical protein  25.62 
 
 
300 aa  46.2  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1217  hypothetical protein  31.86 
 
 
146 aa  46.2  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.430045  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1801  hypothetical protein  31.36 
 
 
134 aa  45.4  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0616836  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0781  hypothetical protein  29.37 
 
 
155 aa  44.7  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.361846  normal  0.832003 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2060  hypothetical protein  25.26 
 
 
196 aa  43.1  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.937601  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0443  protein of unknown function DUF1641  27.03 
 
 
374 aa  42  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.540032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>