19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2278 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_2278  hypothetical protein  100 
 
 
812 aa  1601    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1761  Cytochrome c-552/DMSO reductase-like, heme-binding domain protein  58.35 
 
 
443 aa  482  1e-134  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.11049  normal  0.328486 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3163  hypothetical protein  35.04 
 
 
460 aa  238  3e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0018  hypothetical protein  39.68 
 
 
391 aa  223  9.999999999999999e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0100534  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4020  hypothetical protein  37.43 
 
 
442 aa  211  4e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.811457  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2852  putative di-heme cytochrome c  35.47 
 
 
437 aa  201  6e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.48043  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0719  hypothetical protein  35.89 
 
 
370 aa  191  5.999999999999999e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2564  hypothetical protein  33.89 
 
 
383 aa  162  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0992  hypothetical protein  30.08 
 
 
399 aa  151  5e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00160861  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2718  hypothetical protein  56 
 
 
124 aa  112  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2710  hypothetical protein  25.5 
 
 
367 aa  84  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000170279  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0285  hypothetical protein  28.34 
 
 
465 aa  79.3  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2095  hypothetical protein  25.07 
 
 
434 aa  65.9  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.174556  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3363  hypothetical protein  27.18 
 
 
540 aa  65.9  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0444  hypothetical protein  28.16 
 
 
334 aa  62  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0443  hypothetical protein  29.25 
 
 
325 aa  52.4  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.458149  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4004  hypothetical protein  27.54 
 
 
271 aa  45.1  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0921  hypothetical protein  26.83 
 
 
389 aa  45.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4219  denitrification system component NirT/cytochrome c552  32.65 
 
 
603 aa  44.7  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.50309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>