15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3163 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3163  hypothetical protein  100 
 
 		 460 aa  949    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1761  Cytochrome c-552/DMSO reductase-like, heme-binding domain protein  35.42 
 
 		 443 aa  254  3e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.11049  normal  0.328486 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2278  hypothetical protein  34.31 
 
 		 812 aa  215  9.999999999999999e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4020  hypothetical protein  32.34 
 
 		 442 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.811457  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2852  putative di-heme cytochrome c  30.77 
 
 		 437 aa  149  9e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.48043  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3363  hypothetical protein  28.85 
 
 		 540 aa  103  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0443  hypothetical protein  27.05 
 
 		 325 aa  83.2  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.458149  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0444  hypothetical protein  26.79 
 
 		 334 aa  78.2  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4621  hypothetical protein  25.44 
 
 		 506 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.363519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2718  hypothetical protein  39.53 
 
 		 124 aa  70.9  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0921  hypothetical protein  24.82 
 
 		 389 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0972  hypothetical protein  24.55 
 
 		 389 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.535979  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0975  hypothetical protein  24.82 
 
 		 389 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.620228  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2674  ankyrin  21.99 
 
 		 587 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.256648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0135  ankyrin  22.65 
 
 		 582 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0517938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>