13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0719 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0719  hypothetical protein  100 
 
 
370 aa  728    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2564  hypothetical protein  51.18 
 
 
383 aa  315  9.999999999999999e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0992  hypothetical protein  39.2 
 
 
399 aa  256  3e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00160861  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0018  hypothetical protein  40 
 
 
391 aa  246  6e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0100534  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2278  hypothetical protein  36.47 
 
 
812 aa  181  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2710  hypothetical protein  30.13 
 
 
367 aa  92.8  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000170279  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2095  hypothetical protein  25.45 
 
 
434 aa  90.1  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.174556  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0285  hypothetical protein  31.15 
 
 
465 aa  83.2  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  29.24 
 
 
304 aa  46.6  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 
276 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  27.18 
 
 
278 aa  43.1  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 
283 aa  42.7  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  26.97 
 
 
283 aa  42.7  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>