More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_R0045 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_R0032  tRNA-Ile  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0045  tRNA-Ile  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0016  tRNA-Ile  91.23 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000285507  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0027  tRNA-Ile  91.23 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0032  tRNA-Ile  91.23 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0214663  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0009  tRNA-Ile  88 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0767985  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0004  tRNA-Ile  88 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000939428  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0004  tRNA-Ile  88 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0047  tRNA-Ile  88 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.026073  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0052  tRNA-Ile  88 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0029428  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0036  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0008  tRNA-Ile  91.38 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000696824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0011  tRNA-Ile  91.38 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00277001  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0037  tRNA-Ile  91.38 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000489104  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0044  tRNA-Ile  91.38 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0477159  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0052  tRNA-Ile  91.38 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000626175  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0042  tRNA-Ile  91.38 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0171814  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3075t  tRNA-Ile  91.38 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000646764  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3111t  tRNA-Ile  91.38 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.893532  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0054  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0041  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0043  tRNA-Ile  91.84 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0208406  normal  0.220068 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0023  tRNA-Ile  91.84 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAIleVIMSS1309371  tRNA-Ile  91.84 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.284723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0015  tRNA-Ile  87.69 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.173828  normal  0.314939 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0002  tRNA-Ile  87.69 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0037  tRNA-Ile  91.84 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0006  tRNA-Ile  91.84 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0033  tRNA-Ile  91.84 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0017  tRNA-Ile  91.84 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0314309  normal  0.837845 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0050  tRNA-Ile  91.84 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0010  tRNA-Ile  91.84 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0022  tRNA-Ile  91.84 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000102931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0033  tRNA-Ile  91.84 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000982153  normal  0.21977 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0015  tRNA-Ile  91.84 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000549591  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0028  tRNA-Ile  91.84 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000471614  decreased coverage  0.000367782 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0042  tRNA-Ile  91.84 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0012  tRNA-Ile  91.84 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0028  tRNA-Ile  91.84 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.568304 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0022  tRNA-Ile  91.84 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.362568  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAIleVIMSS1309088  tRNA-Ile  91.84 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAIleVIMSS1309139  tRNA-Ile  91.84 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAIleVIMSS1309203  tRNA-Ile  91.84 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.765225  normal  0.83434 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAIleVIMSS1309281  tRNA-Ile  91.84 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.126115 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAIleVIMSS1309289  tRNA-Ile  91.84 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAIleVIMSS1309162  tRNA-Ile  91.84 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0009  tRNA-Ile  86.67 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00618734  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0024  tRNA-Ile  86.67 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0002  tRNA-Ile  86.67 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000539151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0004  tRNA-Ile  86.67 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000076362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t03  tRNA-Ile  86.67 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0009  tRNA-Ile  86.67 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.425741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0004  tRNA-Ile  86.67 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301418 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0004  tRNA-Ile  86.67 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.147077  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0486  tRNA-Ile  89.66 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.212105  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28350  tRNA-Ile  89.66 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.145936 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0001  tRNA-Ile  89.66 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000567837 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00070  tRNA-Ile  89.66 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000758823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0031  tRNA-Ile  92.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0042  tRNA-Ile  86.15 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0042  tRNA-Ile  92.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00111432  normal  0.385328 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0007  tRNA-Ile  92.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0924996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0036  tRNA-Ile  92.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.432918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0052  tRNA-Ile  92.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0031  tRNA-Ile  86.15 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0830552 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0058  tRNA-Ile  89.47 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.124982  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0009  tRNA-Ile  87.69 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.389462  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0026  tRNA-Ile  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0180152  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0033  tRNA-Ile  87.69 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000392062  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0007  tRNA-Ile  92.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00808178  normal  0.792486 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00061  tRNA-Ile  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0509967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0077  tRNA-Ile  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000248576  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0102  tRNA-Ile  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00845186  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0025  tRNA-Ile  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0513291  unclonable  0.00000384252 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t003  tRNA-Ile  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t096  tRNA-Ile  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0175  tRNA-Ile  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0770081  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5092  tRNA-Ile  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866499  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0008  tRNA-Ile  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0314854  hitchhiker  0.00756038 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0036  tRNA-Ile  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0271306  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0051  tRNA-Ile  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0016  tRNA-Ile  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00171399  hitchhiker  0.0041284 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0008  tRNA-Ile  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289136  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0118  tRNA-Ile  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000845195  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0085  tRNA-Ile  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0425046  normal  0.137972 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0157  tRNA-Ile  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.131945  hitchhiker  0.00000102805 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0011  tRNA-Ile  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0129022  hitchhiker  0.000473278 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0008  tRNA-Ile  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0770657  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0104  tRNA-Ile  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000615074  normal  0.021037 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tIle01  tRNA-Ile  89.58 
 
 		 80 bp  56  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tIle02  tRNA-Ile  89.58 
 
 		 80 bp  56  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0008  tRNA-Ile  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000331872  normal  0.303515 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0072  tRNA-Ile  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0376486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0010  tRNA-Ile  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000891119  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0058  tRNA-Ile  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00171421  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0009  tRNA-Ile  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154814  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0072  tRNA-Ile  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0761618  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0137  tRNA-Ile  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000306582  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0002  tRNA-Ile  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0365419  normal  0.118397 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0084  tRNA-Ile  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0017286  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>