14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_R0001 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_R0001  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000732072  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0002  tRNA-Ala  91.3 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000366023  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0050  tRNA-Ala  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000486604  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.285591  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0007  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.110552  normal  0.490785 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0068  tRNA-Ala  85 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.240621  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0072  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.204663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0014  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000564752  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04940  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.669042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0049  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0254858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0046  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.150337  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0001  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0019  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0037  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>