19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1421 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1421  hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  699    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000365122  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2219  conserved hypothetical protein  27.27 
 
 		 326 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.575853  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1605  hypothetical protein  26.92 
 
 		 326 aa  87  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01396  hypothetical protein  26.92 
 
 		 326 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1509  hypothetical protein  26.57 
 
 		 326 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01385  predicted enzyme  26.92 
 
 		 326 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2232  hypothetical protein  26.57 
 
 		 326 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.349986 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1748  hypothetical protein  26.57 
 
 		 326 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0491471  hitchhiker  1.2299200000000002e-18 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2032  hypothetical protein  26.57 
 
 		 326 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00223283  hitchhiker  5.00351e-16 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1973  putative nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  27.06 
 
 		 326 aa  83.6  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.839188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1551  hypothetical protein  25.59 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1724  hypothetical protein  25.2 
 
 		 326 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1727  hypothetical protein  25.98 
 
 		 326 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.485669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1788  hypothetical protein  25.2 
 
 		 326 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.12852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1732  hypothetical protein  25.2 
 
 		 326 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0445  hypothetical protein  33.77 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2719  hypothetical protein  27.1 
 
 		 164 aa  50.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2208  ribonuclease, Rne/Rng family protein  37.06 
 
 		 1065 aa  48.1  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.162702 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2286  YadA domain-containing protein  24.77 
 
 		 1584 aa  43.5  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0535407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>