Gene HS_1421 details

Gene Information       Plasmid Coverage information       Fosmid Coverage information       Sequence       

Gene Information

Locus tagHS_1421 
Symbol 
ID4240936 
TypeCDS 
Is gene splicedNo 
Is pseudo geneNo 
Organism nameHaemophilus somnus 129PT 
KingdomBacteria 
Replicon accessionNC_008309 
Strand
Start bp1606354 
End bp1607412 
Gene Length1059 bp 
Protein Length352 aa 
Translation table11 
GC content42% 
IMG OID638104998 
Producthypothetical protein 
Protein accessionYP_719633 
Protein GI113461564 
COG category 
COG ID 
TIGRFAM ID 


Plasmid Coverage information

Num covering plasmid clones
Plasmid unclonability p-value0.0000365122 
Plasmid hitchhikingYes 
Plasmid clonabilityhitchhiker 
 

Fosmid Coverage information

Num covering fosmid clonesn/a 
Fosmid unclonability p-valuen/a 
Fosmid Hitchhikern/a 
Fosmid clonabilityn/a 
 

Sequence

Gene sequence
ATGAAAGACC AAGTTCAAAA AAAATACGAA CTTCTTCAAA ATGATACTAT TCAACAGAAT 
GGTAAAACAC TCTACCGAAT TAAAGCATTA ATCTCTTTTG GTGATATAAA GGCGGGTAAG
CTGGGCGGTT ATATTGAGAA AGAGGAAAAT CTAAGTCACG AGGGAAATGC TTGGGTGTCC
GACAATGCTA AAGTGTTTGG CAATGCTAGA GTGTATGGCA ATGCTGAAGT GTTTGGCAAT
GCTAGAGTGT ATGGCAAGGC TAGAGTGTAT GACAATGCTA GAGTGTATGA CGATGCTGAA
GTGTTTGGCA TTGCTGAAGT GTATGGCATT GCTGAAGTGT GTGAAAATGC TATAGTGTAT
GACAATGCTA GAGTGTATGG CAATGCTGAA GTGTTTGGCA ATGCTAGAGT GTATGGCAAG
GCTAGAGTGT ATGACTATGC TATAGTGTGT GACACTGCTG AAGTGTTTGG CAATGCTAGA
GTGTATGGCA AGGCTAGAGT GTATGACTAT GCTATAGTGT GTGACACTGC TGAAGTGTTT
GGCAAGGCTA GAGTGTATGA CTATGCTATA GTGTGTGACA CTGCTGAAGT GTTTGGCAAT
GCTAGAGTGT ATGGCAAGGC TAGAGTGTAT GACTATGCTA TAGTGTGTGA CACTGCTGAA
GTGTTTGGCA AGGCTAGAGT GTATGGCAAG GCTAGAGTGT ATGACTATGC TATAGTGTGT
GACACTGCTG AAGTGTTTGG CAATGCTAGA GTGTGTGGCA AGGCTAAAGT GTTTGGCAAT
GCTAGAGTGT GTGACACTGC TTTGGTGTGT AGAAGTGACT TTATATGTAA AAATGCATTT
ATCTCAAAAG AAAGTGATGT CTTTTCCGCA AGTTATGTAG GAAGGGAAAA CGGCGTATTA
ACTGTGTATA AAACCGAAAA TGAATTGTAT GCAACACGAG GCTGTTTTGT TGGTCCGGTG
GAGGAGTTTT TGCAACAATC CGCCAAGGTC CATGATGAGA AAACTCATCG GGAATATCAG
CTGCTGATTG AGGTAGCGAG AAGTCGCATT CTTAAATAA
 
Protein sequence
MKDQVQKKYE LLQNDTIQQN GKTLYRIKAL ISFGDIKAGK LGGYIEKEEN LSHEGNAWVS 
DNAKVFGNAR VYGNAEVFGN ARVYGKARVY DNARVYDDAE VFGIAEVYGI AEVCENAIVY
DNARVYGNAE VFGNARVYGK ARVYDYAIVC DTAEVFGNAR VYGKARVYDY AIVCDTAEVF
GKARVYDYAI VCDTAEVFGN ARVYGKARVY DYAIVCDTAE VFGKARVYGK ARVYDYAIVC
DTAEVFGNAR VCGKAKVFGN ARVCDTALVC RSDFICKNAF ISKESDVFSA SYVGRENGVL
TVYKTENELY ATRGCFVGPV EEFLQQSAKV HDEKTHREYQ LLIEVARSRI LK