65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4062 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4062  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  611  9.999999999999999e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.055967  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3710  protein of unknown function DUF1385  80.26 
 
 		 301 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.010982  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3805  protein of unknown function DUF1385  79.61 
 
 		 301 aa  510  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2648  hypothetical protein  80.19 
 
 		 308 aa  495  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267473  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0379  hypothetical protein  82.12 
 
 		 316 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0386934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1028  protein of unknown function DUF1385  77.2 
 
 		 307 aa  487  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0122365  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3105  hypothetical protein  79.8 
 
 		 317 aa  486  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.837646  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3171  hypothetical protein  52.4 
 
 		 292 aa  294  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000104727  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0063  protein of unknown function DUF1385  55.9 
 
 		 291 aa  290  1e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000382  hitchhiker  0.00259146 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2155  hypothetical protein  49.16 
 
 		 308 aa  290  2e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000573761  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0092  hypothetical protein  47.23 
 
 		 308 aa  279  5e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0158548  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2398  hypothetical protein  48.5 
 
 		 302 aa  277  1e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000248355  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4473  hypothetical protein  47.42 
 
 		 327 aa  274  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2873  protein of unknown function DUF1385  48.16 
 
 		 295 aa  267  1e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000122593  hitchhiker  0.0000000114155 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2398  hypothetical protein  52.67 
 
 		 318 aa  258  1e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.625274 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17980  predicted metal-dependent enzyme  46.39 
 
 		 293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000596549  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0804  protein of unknown function DUF1385  46.83 
 
 		 294 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000749305  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2139  hypothetical protein  48.12 
 
 		 313 aa  249  4e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2177  HemK family modification methylase  44 
 
 		 587 aa  245  6e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000299232  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1732  hypothetical protein  49.29 
 
 		 313 aa  245  6.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2427  hypothetical protein  43.95 
 
 		 318 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000256327  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2467  HemK family methyltransferase  43.33 
 
 		 587 aa  243  3e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.222509  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1110  hypothetical protein  46.46 
 
 		 307 aa  241  9e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000475051  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1328  hypothetical protein  45.79 
 
 		 307 aa  240  2e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.23173  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1653  hypothetical protein  44.37 
 
 		 302 aa  238  8e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2456  protein of unknown function DUF1385  41.41 
 
 		 301 aa  237  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1042  hypothetical protein  46.92 
 
 		 285 aa  236  4e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.014485  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0850  protein of unknown function DUF1385  42.51 
 
 		 292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.218612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3374  protein of unknown function DUF1385  42.16 
 
 		 308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0363757  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0844  hypothetical protein  43.25 
 
 		 307 aa  231  9e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1139  hypothetical protein  44.78 
 
 		 306 aa  231  1e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00478195  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09240  predicted metal-dependent enzyme  37.57 
 
 		 391 aa  229  3e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.196919  normal  0.0286438 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1242  hypothetical protein  45.82 
 
 		 296 aa  226  3e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1213  hypothetical protein  45.82 
 
 		 296 aa  226  3e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.727147  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0441  hypothetical protein  43.79 
 
 		 304 aa  222  6e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000672255  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0412  hypothetical protein  43.15 
 
 		 532 aa  219  3e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452863  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0082  protein of unknown function DUF1385  36.45 
 
 		 352 aa  219  3.9999999999999997e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.547452  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1069  protein of unknown function DUF1385  39.48 
 
 		 313 aa  219  5e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.232778  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0035  hypothetical protein  42.52 
 
 		 320 aa  216  2.9999999999999998e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000618498  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0984  hypothetical protein  41.32 
 
 		 315 aa  214  9.999999999999999e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0062  protein of unknown function DUF1385  46.88 
 
 		 295 aa  214  9.999999999999999e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000147112  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0452  putative lipoprotein  42.53 
 
 		 335 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20010  predicted metal-dependent enzyme  40.46 
 
 		 342 aa  212  4.9999999999999996e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2797  protein of unknown function DUF1385  40.82 
 
 		 311 aa  205  6e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17231  normal  0.519199 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2983  putative lipoprotein  40.13 
 
 		 337 aa  202  5e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1443  protein of unknown function DUF1385  42.19 
 
 		 359 aa  195  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2300  protein of unknown function DUF1385  40.86 
 
 		 304 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0230  protein of unknown function DUF1385  38.49 
 
 		 311 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4221  hypothetical protein  36.82 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4425  hypothetical protein  36.82 
 
 		 306 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4105  hypothetical protein  36.82 
 
 		 306 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3954  hypothetical protein  36.82 
 
 		 306 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4331  hypothetical protein  36.82 
 
 		 306 aa  179  7e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4311  hypothetical protein  36.82 
 
 		 306 aa  178  8e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4274  hypothetical protein  36.49 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2343  protein of unknown function DUF1385  36.51 
 
 		 314 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0923  hypothetical protein  36.82 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4054  hypothetical protein  36.82 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2895  hypothetical protein  35.59 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0132011  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1129  protein of unknown function DUF1385  41.06 
 
 		 468 aa  169  8e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.946733  hitchhiker  0.000313529 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3943  hypothetical protein  36.76 
 
 		 288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0820  protein of unknown function DUF1385  38.44 
 
 		 324 aa  160  2e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00433715  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3638  protein of unknown function DUF1385  32.03 
 
 		 281 aa  75.9  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0037  metal-dependent enzyme-like protein  27.36 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1262  hypothetical protein  30.58 
 
 		 257 aa  50.8  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.986286  normal  0.904358 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>