64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1443 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1443  protein of unknown function DUF1385  100 
 
 
359 aa  717    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0452  putative lipoprotein  81.62 
 
 
335 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2983  putative lipoprotein  68.94 
 
 
337 aa  437  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2300  protein of unknown function DUF1385  66.56 
 
 
304 aa  378  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2648  hypothetical protein  43.75 
 
 
308 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267473  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3171  hypothetical protein  39.39 
 
 
292 aa  200  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000104727  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4062  hypothetical protein  42.19 
 
 
304 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.055967  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3805  protein of unknown function DUF1385  41.53 
 
 
301 aa  198  9e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3710  protein of unknown function DUF1385  41.2 
 
 
301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.010982  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2155  hypothetical protein  40.07 
 
 
308 aa  195  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000573761  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1028  protein of unknown function DUF1385  40.39 
 
 
307 aa  193  4e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0122365  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0063  protein of unknown function DUF1385  39.93 
 
 
291 aa  192  7e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000382  hitchhiker  0.00259146 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2456  protein of unknown function DUF1385  35.67 
 
 
301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3105  hypothetical protein  41.53 
 
 
317 aa  187  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.837646  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0379  hypothetical protein  40.4 
 
 
316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0386934  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0850  protein of unknown function DUF1385  38.36 
 
 
292 aa  182  6e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.218612  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2177  HemK family modification methylase  37.22 
 
 
587 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000299232  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2467  HemK family methyltransferase  37.66 
 
 
587 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.222509  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0441  hypothetical protein  38.72 
 
 
304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000672255  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0412  hypothetical protein  38.18 
 
 
532 aa  179  7e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452863  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4473  hypothetical protein  36.62 
 
 
327 aa  176  6e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0804  protein of unknown function DUF1385  35.29 
 
 
294 aa  176  8e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000749305  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1042  hypothetical protein  36.95 
 
 
285 aa  175  9e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.014485  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2873  protein of unknown function DUF1385  37.42 
 
 
295 aa  173  3.9999999999999995e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000122593  hitchhiker  0.0000000114155 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0092  hypothetical protein  35.58 
 
 
308 aa  173  5e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0158548  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0082  protein of unknown function DUF1385  36.79 
 
 
352 aa  172  5.999999999999999e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.547452  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1732  hypothetical protein  40.61 
 
 
313 aa  171  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2427  hypothetical protein  32.7 
 
 
318 aa  171  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000256327  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2139  hypothetical protein  40.48 
 
 
313 aa  171  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1242  hypothetical protein  38.61 
 
 
296 aa  170  3e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1213  hypothetical protein  38.61 
 
 
296 aa  170  3e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.727147  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0035  hypothetical protein  34.54 
 
 
320 aa  168  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000618498  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2398  hypothetical protein  36.63 
 
 
302 aa  167  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000248355  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17980  predicted metal-dependent enzyme  37.46 
 
 
293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000596549  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2797  protein of unknown function DUF1385  37.79 
 
 
311 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17231  normal  0.519199 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20010  predicted metal-dependent enzyme  38.31 
 
 
342 aa  162  1e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1110  hypothetical protein  38.82 
 
 
307 aa  160  2e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000475051  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2398  hypothetical protein  38.81 
 
 
318 aa  161  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.625274 
 
 
-
 
NC_002936  DET1328  hypothetical protein  38.82 
 
 
307 aa  160  3e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.23173  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1653  hypothetical protein  39.48 
 
 
302 aa  160  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0844  hypothetical protein  37.46 
 
 
307 aa  159  8e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0984  hypothetical protein  36.63 
 
 
315 aa  159  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1139  hypothetical protein  40.07 
 
 
306 aa  158  1e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00478195  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3374  protein of unknown function DUF1385  31.03 
 
 
308 aa  152  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0363757  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1069  protein of unknown function DUF1385  32.39 
 
 
313 aa  149  8e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.232778  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0820  protein of unknown function DUF1385  36.54 
 
 
324 aa  145  1e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00433715  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0230  protein of unknown function DUF1385  35.4 
 
 
311 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2343  protein of unknown function DUF1385  33.33 
 
 
314 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4331  hypothetical protein  32.92 
 
 
306 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4274  hypothetical protein  32.6 
 
 
306 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4425  hypothetical protein  32.6 
 
 
306 aa  136  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3954  hypothetical protein  32.6 
 
 
306 aa  137  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4105  hypothetical protein  32.6 
 
 
306 aa  136  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4054  hypothetical protein  32.6 
 
 
306 aa  135  8e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4221  hypothetical protein  32.29 
 
 
306 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4311  hypothetical protein  32.6 
 
 
306 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0923  hypothetical protein  32.6 
 
 
306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2895  hypothetical protein  31.87 
 
 
308 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0132011  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0062  protein of unknown function DUF1385  38.64 
 
 
295 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000147112  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09240  predicted metal-dependent enzyme  33.06 
 
 
391 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.196919  normal  0.0286438 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1129  protein of unknown function DUF1385  41.67 
 
 
468 aa  121  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.946733  hitchhiker  0.000313529 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3943  hypothetical protein  33.11 
 
 
288 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0037  metal-dependent enzyme-like protein  35 
 
 
279 aa  66.2  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3638  protein of unknown function DUF1385  39.06 
 
 
281 aa  44.3  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>