65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1328 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1328  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  622  1e-177  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.23173  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1110  hypothetical protein  99.35 
 
 
307 aa  619  1e-176  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000475051  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1139  hypothetical protein  94.14 
 
 
306 aa  556  1e-157  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00478195  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1028  protein of unknown function DUF1385  47.25 
 
 
307 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0122365  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2139  hypothetical protein  46.92 
 
 
313 aa  258  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0844  hypothetical protein  45.21 
 
 
307 aa  254  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1732  hypothetical protein  48.55 
 
 
313 aa  253  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4062  hypothetical protein  46.46 
 
 
304 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.055967  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3105  hypothetical protein  46.82 
 
 
317 aa  250  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.837646  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3805  protein of unknown function DUF1385  46.26 
 
 
301 aa  248  8e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2648  hypothetical protein  45.03 
 
 
308 aa  247  2e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267473  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3710  protein of unknown function DUF1385  45.42 
 
 
301 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.010982  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0379  hypothetical protein  47.84 
 
 
316 aa  243  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0386934  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2155  hypothetical protein  43.86 
 
 
308 aa  242  5e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000573761  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2398  hypothetical protein  44.19 
 
 
302 aa  235  6e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000248355  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0063  protein of unknown function DUF1385  45.26 
 
 
291 aa  230  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000382  hitchhiker  0.00259146 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2873  protein of unknown function DUF1385  45.49 
 
 
295 aa  229  3e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000122593  hitchhiker  0.0000000114155 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0804  protein of unknown function DUF1385  42.05 
 
 
294 aa  227  2e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000749305  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1653  hypothetical protein  44.37 
 
 
302 aa  225  9e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0092  hypothetical protein  41.14 
 
 
308 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0158548  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2797  protein of unknown function DUF1385  39.79 
 
 
311 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17231  normal  0.519199 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3171  hypothetical protein  43.01 
 
 
292 aa  216  4e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000104727  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2427  hypothetical protein  39.06 
 
 
318 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000256327  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1069  protein of unknown function DUF1385  40.2 
 
 
313 aa  209  3e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.232778  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0062  protein of unknown function DUF1385  47.48 
 
 
295 aa  208  8e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000147112  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2398  hypothetical protein  45.68 
 
 
318 aa  207  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.625274 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2456  protein of unknown function DUF1385  40.96 
 
 
301 aa  207  3e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0412  hypothetical protein  41.2 
 
 
532 aa  200  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452863  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4473  hypothetical protein  38.54 
 
 
327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0035  hypothetical protein  39.29 
 
 
320 aa  196  5.000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000618498  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1042  hypothetical protein  42.5 
 
 
285 aa  195  9e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.014485  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0082  protein of unknown function DUF1385  36.36 
 
 
352 aa  194  1e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.547452  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3374  protein of unknown function DUF1385  37.67 
 
 
308 aa  194  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0363757  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17980  predicted metal-dependent enzyme  41.58 
 
 
293 aa  194  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000596549  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20010  predicted metal-dependent enzyme  38.76 
 
 
342 aa  191  1e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0850  protein of unknown function DUF1385  36.08 
 
 
292 aa  187  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.218612  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1213  hypothetical protein  39.32 
 
 
296 aa  183  3e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.727147  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1242  hypothetical protein  39.32 
 
 
296 aa  183  3e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0452  putative lipoprotein  38.92 
 
 
335 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2467  HemK family methyltransferase  37.7 
 
 
587 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.222509  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2177  HemK family modification methylase  37.7 
 
 
587 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000299232  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0441  hypothetical protein  37.06 
 
 
304 aa  176  6e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000672255  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2983  putative lipoprotein  38.26 
 
 
337 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1443  protein of unknown function DUF1385  38.82 
 
 
359 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2300  protein of unknown function DUF1385  37.71 
 
 
304 aa  167  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0984  hypothetical protein  36.88 
 
 
315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0230  protein of unknown function DUF1385  33.44 
 
 
311 aa  165  8e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09240  predicted metal-dependent enzyme  40.89 
 
 
391 aa  165  9e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.196919  normal  0.0286438 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1129  protein of unknown function DUF1385  39.57 
 
 
468 aa  165  1.0000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.946733  hitchhiker  0.000313529 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2343  protein of unknown function DUF1385  34.11 
 
 
314 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4311  hypothetical protein  32.9 
 
 
306 aa  155  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0923  hypothetical protein  32.9 
 
 
306 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2895  hypothetical protein  31.44 
 
 
308 aa  155  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0132011  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0820  protein of unknown function DUF1385  35.91 
 
 
324 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00433715  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4054  hypothetical protein  32.25 
 
 
306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4221  hypothetical protein  32.44 
 
 
306 aa  153  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3954  hypothetical protein  32.57 
 
 
306 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4105  hypothetical protein  32.57 
 
 
306 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4331  hypothetical protein  32.57 
 
 
306 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4425  hypothetical protein  32.57 
 
 
306 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4274  hypothetical protein  32.57 
 
 
306 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3943  hypothetical protein  30.45 
 
 
288 aa  133  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0037  metal-dependent enzyme-like protein  24.32 
 
 
279 aa  53.9  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1262  hypothetical protein  26.4 
 
 
257 aa  46.2  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.986286  normal  0.904358 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3638  protein of unknown function DUF1385  26.76 
 
 
281 aa  45.4  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>