98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3328 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3328  putative ion transporting ATPase  100 
 
 
385 aa  689    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3232  arsenite-activated ATPase ArsA  35.64 
 
 
409 aa  138  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00988964  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1387  Arsenite-transporting ATPase  35.61 
 
 
406 aa  115  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.517206  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3111  arsenite-transporting ATPase  32.84 
 
 
410 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3094  arsenite-transporting ATPase  33.72 
 
 
404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.968228 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1823  arsenite-transporting ATPase  34.81 
 
 
401 aa  103  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.702579  normal  0.326449 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0297  arsenite-activated ATPase ArsA  23.64 
 
 
393 aa  103  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0363  anion-transporting ATPase family protein  23.12 
 
 
393 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0390  anion-transporting ATPase family protein  23.51 
 
 
393 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0346  arsenite-activated ATPase (arsA)  23.51 
 
 
392 aa  100  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4957  anion-transporting ATPase family protein  22.6 
 
 
392 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0349  anion-transporting ATPase family protein  22.86 
 
 
393 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0285  anion-transporting ATPase  22.86 
 
 
393 aa  99  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0288  arsenite-transporting ATPase  23.12 
 
 
393 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1697  arsenite-activated ATPase ArsA  21.91 
 
 
393 aa  95.9  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3290  arsenite-transporting ATPase  32.48 
 
 
421 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3341  arsenite-transporting ATPase  32.48 
 
 
421 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0464361  normal  0.354276 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3279  arsenite-transporting ATPase  32.48 
 
 
421 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2699  Arsenite-transporting ATPase  32.9 
 
 
389 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.768822  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1698  arsenite-transporting ATPase  21.54 
 
 
385 aa  92.8  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1259  arsenite-activated ATPase (arsA)  26.36 
 
 
392 aa  91.7  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.833931  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2193  arsenite-activated ATPase ArsA  25.06 
 
 
384 aa  90.9  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3240  arsenite-activated ATPase ArsA  26.32 
 
 
390 aa  89.4  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.600829  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2143  arsenite-activated ATPase ArsA  24.12 
 
 
384 aa  89.4  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.237468  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2570  Arsenite-transporting ATPase  25.27 
 
 
384 aa  89  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00281236  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2965  anion-transporting ATPase  32.69 
 
 
381 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1958  arsenite-activated ATPase ArsA  24.4 
 
 
384 aa  85.9  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.367574  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3546  arsenite-transporting ATPase  30.41 
 
 
430 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.614872  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2297  arsenite-activated ATPase ArsA  24.87 
 
 
384 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.680488  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0222  arsenite-activated ATPase ArsA  25.4 
 
 
395 aa  85.5  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.267897  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2956  arsenite-activated ATPase ArsA  26.09 
 
 
394 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00895235  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0267  anion-transporting ATPase  25.19 
 
 
384 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.138882  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2084  arsenite-activated ATPase ArsA  25.41 
 
 
395 aa  84.3  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0397137  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0217  anion-transporting ATPase  23.87 
 
 
385 aa  84  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173989  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0928  arsenite-activated ATPase ArsA  27.1 
 
 
396 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.825229 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1511  arsenite-activated ATPase ArsA  22.87 
 
 
397 aa  83.6  0.000000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155011  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0013  arsenite-activated ATPase ArsA  25.41 
 
 
395 aa  82.4  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0117  anion-transporting ATPase  26.49 
 
 
401 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4268  anion-transporting ATPase  25.27 
 
 
395 aa  80.9  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.159694 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1570  arsenite-activated ATPase ArsA  27.1 
 
 
396 aa  80.5  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.807387  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0908  arsenite-activated ATPase ArsA  26.99 
 
 
404 aa  80.1  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.26902  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0221  anion-transporting ATPase  24.8 
 
 
408 aa  79.7  0.00000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12212  hypothetical protein  30.7 
 
 
380 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0253  arsenite-activated ATPase ArsA  23.8 
 
 
399 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1962  arsenite-activated ATPase ArsA  24.25 
 
 
405 aa  77.4  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000471213  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3879  arsenite-activated ATPase ArsA  27.39 
 
 
391 aa  77.4  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2364  arsenite-activated ATPase ArsA  24.32 
 
 
395 aa  77  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1223  arsenite-activated ATPase ArsA  27.63 
 
 
399 aa  76.6  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.293801  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3600  arsenite-activated ATPase ArsA  25.2 
 
 
397 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2514  arsenite-activated ATPase ArsA  25.2 
 
 
397 aa  76.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.138109  normal  0.232029 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2756  arsenite-activated ATPase ArsA  24.14 
 
 
407 aa  75.9  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1314  arsenite-activated ATPase (arsA)  28.76 
 
 
394 aa  75.5  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.735372  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1521  arsenite-activated ATPase ArsA  25.06 
 
 
395 aa  75.5  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00129827  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2574  arsenite-activated ATPase ArsA  24.53 
 
 
408 aa  75.1  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295294  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2147  arsenite-activated ATPase ArsA  24.19 
 
 
405 aa  74.3  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.686862  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2198  arsenite-activated ATPase ArsA  23.85 
 
 
405 aa  73.9  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.416717 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24880  oxyanion-translocating ATPase  32 
 
 
377 aa  73.2  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.66061  normal  0.410485 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1378  anion-transporting ATPase  23.57 
 
 
396 aa  72  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0213  arsenite-activated ATPase ArsA  25 
 
 
392 aa  72  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.410604  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0263  anion-transporting ATPase  24.19 
 
 
406 aa  72  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.069597  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1216  arsenite-activated ATPase ArsA  24.33 
 
 
400 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3278  arsenite-activated ATPase ArsA  24.05 
 
 
394 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0078  arsenite-activated ATPase ArsA  25 
 
 
396 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.121619  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0303  anion-transporting ATPase, N-terminus  27.54 
 
 
169 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2301  arsenite-activated ATPase ArsA  24.73 
 
 
405 aa  69.7  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0024147  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0312  arsenite-activated ATPase ArsA  26.26 
 
 
397 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1248  arsenite-activated ATPase ArsA  23.53 
 
 
407 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.245815  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0070  anion-transporting ATPase  25.19 
 
 
406 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1173  anion-transporting ATPase  23.66 
 
 
396 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.167129 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6065  ion transporting ATPase  30 
 
 
417 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1219  Arsenite-transporting ATPase  26.8 
 
 
407 aa  64.3  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0115  arsenite-activated ATPase ArsA  24.8 
 
 
404 aa  63.9  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0966  arsenite-activated ATPase ArsA  24.23 
 
 
397 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1088  arsenite-activated ATPase ArsA  23.66 
 
 
395 aa  62.8  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.782242  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3043  chromosome partitioning ATPase  27.63 
 
 
405 aa  61.6  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.859354  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1125  arsenite-activated ATPase ArsA  24.87 
 
 
398 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.485276  normal  0.386119 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0091  arsenite-activated ATPase ArsA  27.63 
 
 
402 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.304953  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1353  arsenite-activated ATPase ArsA  24.4 
 
 
397 aa  56.2  0.0000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284232  hitchhiker  0.00308524 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0457  anion-transporting ATPase  24.24 
 
 
433 aa  55.8  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.328164  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0797  arsenite-activated ATPase ArsA  22.31 
 
 
433 aa  54.7  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.541359  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2677  arsenite-transporting ATPase  28.23 
 
 
404 aa  52.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.12364  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1412  anion-transporting ATPase  21.57 
 
 
434 aa  51.6  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2215  arsenite-activated ATPase ArsA  23.02 
 
 
433 aa  51.6  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0892  arsenite-transporting ATPase  21.08 
 
 
334 aa  48.5  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.449464  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0678  arsenite-activated ATPase ArsA  21.82 
 
 
433 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.689675  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1679  arsenite-activated ATPase ArsA  21.07 
 
 
434 aa  48.9  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2461  arsenite-activated ATPase ArsA  32.2 
 
 
345 aa  47.8  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1168  arsenite-activated ATPase ArsA  21.97 
 
 
345 aa  46.2  0.0009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0862  arsenite-activated ATPase ArsA  20.59 
 
 
334 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1512  arsenite-activated ATPase ArsA  21.18 
 
 
345 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.662645  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0787  arsenite-activated ATPase ArsA  21.3 
 
 
344 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0650  arsenite-activated ATPase ArsA  29.18 
 
 
588 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0171508 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2637  anion-transporting ATPase  25.87 
 
 
590 aa  44.7  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.473292  normal  0.577432 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0184  arsenite-activated ATPase ArsA  26.42 
 
 
603 aa  44.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.156138  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2187  arsenical pump-driving ATPase  30.19 
 
 
586 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0551  arsenite-activated ATPase ArsA  21.05 
 
 
433 aa  44.3  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0209  arsenite-activated ATPase ArsA  28.3 
 
 
621 aa  43.1  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0354  arsenite-activated ATPase ArsA  25.49 
 
 
580 aa  43.1  0.009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>