72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3043 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3043  chromosome partitioning ATPase  100 
 
 
405 aa  790    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.859354  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2965  anion-transporting ATPase  31.92 
 
 
381 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3279  arsenite-transporting ATPase  32.17 
 
 
421 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3341  arsenite-transporting ATPase  32.17 
 
 
421 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0464361  normal  0.354276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3290  arsenite-transporting ATPase  32.17 
 
 
421 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12212  hypothetical protein  31.09 
 
 
380 aa  125  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3546  arsenite-transporting ATPase  30.94 
 
 
430 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.614872  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2677  arsenite-transporting ATPase  30.32 
 
 
404 aa  102  8e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.12364  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1387  Arsenite-transporting ATPase  31.68 
 
 
406 aa  93.6  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.517206  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3232  arsenite-activated ATPase ArsA  28.42 
 
 
409 aa  93.2  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00988964  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0312  arsenite-activated ATPase ArsA  24.43 
 
 
397 aa  80.1  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3111  arsenite-transporting ATPase  27.37 
 
 
410 aa  76.6  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3094  arsenite-transporting ATPase  26.9 
 
 
404 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.968228 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2699  Arsenite-transporting ATPase  25.81 
 
 
389 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.768822  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24880  oxyanion-translocating ATPase  27.18 
 
 
377 aa  68.9  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.66061  normal  0.410485 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0221  anion-transporting ATPase  20.52 
 
 
408 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2193  arsenite-activated ATPase ArsA  20.38 
 
 
384 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1248  arsenite-activated ATPase ArsA  21.15 
 
 
407 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.245815  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2574  arsenite-activated ATPase ArsA  20.98 
 
 
408 aa  67.4  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295294  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1216  arsenite-activated ATPase ArsA  21.53 
 
 
400 aa  67  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1223  arsenite-activated ATPase ArsA  22.34 
 
 
399 aa  67  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.293801  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2570  Arsenite-transporting ATPase  20.53 
 
 
384 aa  66.2  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00281236  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2198  arsenite-activated ATPase ArsA  21.71 
 
 
405 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.416717 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2756  arsenite-activated ATPase ArsA  20.43 
 
 
407 aa  63.5  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2301  arsenite-activated ATPase ArsA  20.98 
 
 
405 aa  63.5  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0024147  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1679  arsenite-activated ATPase ArsA  22.52 
 
 
434 aa  63.2  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6065  ion transporting ATPase  28.78 
 
 
417 aa  63.2  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1958  arsenite-activated ATPase ArsA  19.81 
 
 
384 aa  62.4  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.367574  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0797  arsenite-activated ATPase ArsA  22.52 
 
 
433 aa  62  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.541359  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0678  arsenite-activated ATPase ArsA  22.14 
 
 
433 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.689675  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1962  arsenite-activated ATPase ArsA  21 
 
 
405 aa  60.8  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000471213  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1823  arsenite-transporting ATPase  27.65 
 
 
401 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.702579  normal  0.326449 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0217  anion-transporting ATPase  20.25 
 
 
385 aa  60.5  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173989  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2297  arsenite-activated ATPase ArsA  20.81 
 
 
384 aa  60.1  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.680488  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0551  arsenite-activated ATPase ArsA  21.76 
 
 
433 aa  60.1  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0263  anion-transporting ATPase  20.15 
 
 
406 aa  60.1  0.00000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.069597  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0363  anion-transporting ATPase family protein  17.66 
 
 
393 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0288  arsenite-transporting ATPase  18.16 
 
 
393 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3240  arsenite-activated ATPase ArsA  22.38 
 
 
390 aa  59.3  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.600829  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1698  arsenite-transporting ATPase  22.34 
 
 
385 aa  58.2  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2215  arsenite-activated ATPase ArsA  22.27 
 
 
433 aa  58.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0297  arsenite-activated ATPase ArsA  18.41 
 
 
393 aa  58.9  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0349  anion-transporting ATPase family protein  17.66 
 
 
393 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2147  arsenite-activated ATPase ArsA  19.81 
 
 
405 aa  57  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.686862  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0457  anion-transporting ATPase  21.46 
 
 
433 aa  57  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.328164  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4957  anion-transporting ATPase family protein  17.16 
 
 
392 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1412  anion-transporting ATPase  20.91 
 
 
434 aa  56.6  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0117  anion-transporting ATPase  20.77 
 
 
401 aa  56.2  0.0000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0346  arsenite-activated ATPase (arsA)  18.07 
 
 
392 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0213  arsenite-activated ATPase ArsA  21.89 
 
 
392 aa  56.2  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.410604  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0267  anion-transporting ATPase  20.29 
 
 
384 aa  55.8  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.138882  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0285  anion-transporting ATPase  17.66 
 
 
393 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1219  Arsenite-transporting ATPase  23.87 
 
 
407 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0390  anion-transporting ATPase family protein  18.07 
 
 
393 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1697  arsenite-activated ATPase ArsA  20.29 
 
 
393 aa  54.7  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0078  arsenite-activated ATPase ArsA  20.73 
 
 
396 aa  54.3  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.121619  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2143  arsenite-activated ATPase ArsA  20.53 
 
 
384 aa  53.1  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.237468  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0070  anion-transporting ATPase  21.41 
 
 
406 aa  52.8  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3879  arsenite-activated ATPase ArsA  20.05 
 
 
391 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0875  anion-transporting ATPase  22.3 
 
 
364 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0691273 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2084  arsenite-activated ATPase ArsA  20.85 
 
 
395 aa  49.7  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0397137  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2781  Anion-transporting ATPase  25.23 
 
 
367 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.251695 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0115  arsenite-activated ATPase ArsA  21.3 
 
 
404 aa  46.6  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3342  anion-transporting ATPase  25.68 
 
 
366 aa  46.6  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0928  arsenite-activated ATPase ArsA  19.88 
 
 
396 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.825229 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0013  arsenite-activated ATPase ArsA  19.95 
 
 
395 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1570  arsenite-activated ATPase ArsA  19.94 
 
 
396 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.807387  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3328  putative ion transporting ATPase  44.59 
 
 
385 aa  44.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0303  anion-transporting ATPase, N-terminus  21.71 
 
 
169 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4268  anion-transporting ATPase  19.88 
 
 
395 aa  43.9  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.159694 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0222  arsenite-activated ATPase ArsA  21.85 
 
 
395 aa  43.1  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.267897  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1259  arsenite-activated ATPase (arsA)  19.54 
 
 
392 aa  42.7  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.833931  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>