14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1862 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1862  fimbrial assembly  100 
 
 		 179 aa  356  9.999999999999999e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.598496 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1926  fimbrial assembly family protein  50 
 
 		 179 aa  188  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1781  hypothetical protein  47.19 
 
 		 179 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283906  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1281  Fimbrial assembly family protein  44.51 
 
 		 178 aa  151  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3002  Fimbrial assembly family protein  42.13 
 
 		 178 aa  150  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000637967 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2418  fimbrial assembly family protein  31.07 
 
 		 180 aa  95.1  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0133  hypothetical protein  24.34 
 
 		 187 aa  52.8  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1465  Fimbrial assembly family protein  30.93 
 
 		 182 aa  52.8  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2417  fimbrial assembly  32.67 
 
 		 179 aa  51.6  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1577  hypothetical protein  23.87 
 
 		 546 aa  48.5  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.121402 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1339  hypothetical protein  27.07 
 
 		 174 aa  42.4  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1682  hypothetical protein  24.12 
 
 		 180 aa  42.4  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002323  type IV pilus biogenesis protein PilN  25.4 
 
 		 191 aa  41.6  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0915694  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3225  hypothetical protein  30.95 
 
 		 178 aa  41.2  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.20001 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>