20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2417 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2417  fimbrial assembly  100 
 
 
179 aa  358  3e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2456  hypothetical protein  37.21 
 
 
180 aa  77.8  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3481  hypothetical protein  33.12 
 
 
180 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.605279 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2290  hypothetical protein  33.14 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.050869  normal  0.803647 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2465  hypothetical protein  32.92 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1984  fimbrial assembly  36.21 
 
 
181 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207869  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2616  fimbrial assembly  33.64 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.863286 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29130  hypothetical protein  34.29 
 
 
180 aa  68.2  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.46889  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2586  transmembrane protein  31.07 
 
 
174 aa  62  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3881  hypothetical protein  38.14 
 
 
452 aa  58.9  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1297  transmembrane protein  36.36 
 
 
178 aa  57.4  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.111921  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4709  hypothetical protein  34.21 
 
 
176 aa  56.6  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1339  hypothetical protein  28.21 
 
 
174 aa  55.5  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02974  hypothetical protein  29.91 
 
 
172 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.510739  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2306  hypothetical protein  31.36 
 
 
176 aa  53.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.256089  normal  0.206542 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1781  hypothetical protein  33.98 
 
 
179 aa  50.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283906  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2418  fimbrial assembly family protein  28.57 
 
 
180 aa  47  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1281  Fimbrial assembly family protein  27.81 
 
 
178 aa  45.1  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3225  hypothetical protein  26.09 
 
 
178 aa  41.6  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.20001 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1926  fimbrial assembly family protein  32.43 
 
 
179 aa  41.6  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>