15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1781 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1781  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  360  8e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283906  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1926  fimbrial assembly family protein  49.44 
 
 		 179 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1862  fimbrial assembly  47.19 
 
 		 179 aa  150  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.598496 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1281  Fimbrial assembly family protein  40.45 
 
 		 178 aa  138  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3002  Fimbrial assembly family protein  39.89 
 
 		 178 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000637967 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2418  fimbrial assembly family protein  37.29 
 
 		 180 aa  107  9.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0133  hypothetical protein  25.13 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1465  Fimbrial assembly family protein  28.89 
 
 		 182 aa  52.8  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2465  hypothetical protein  28.71 
 
 		 180 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2417  fimbrial assembly  33.98 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3481  hypothetical protein  27.1 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.605279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2456  hypothetical protein  25 
 
 		 180 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2290  hypothetical protein  26.73 
 
 		 180 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.050869  normal  0.803647 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1984  fimbrial assembly  24.03 
 
 		 181 aa  42.4  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207869  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1577  hypothetical protein  27.45 
 
 		 546 aa  40.8  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.121402 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>