11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0133 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0133  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  381  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3002  Fimbrial assembly family protein  29.23 
 
 		 178 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000637967 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1281  Fimbrial assembly family protein  27.98 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1682  hypothetical protein  28.72 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1781  hypothetical protein  28.85 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283906  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1926  fimbrial assembly family protein  25 
 
 		 179 aa  51.6  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1339  hypothetical protein  28.87 
 
 		 174 aa  49.3  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2456  hypothetical protein  27.08 
 
 		 180 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2465  hypothetical protein  25.55 
 
 		 180 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2586  transmembrane protein  23.53 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2418  fimbrial assembly family protein  27.61 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>