17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0609 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0609    100 
 
 
546 bp  1082    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2646  transposase IS4 family protein  99.82 
 
 
1119 bp  1072    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2974  transposase IS4 family protein  94.48 
 
 
939 bp  559  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2344  transposase IS4 family protein  99.05 
 
 
786 bp  402  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.718047  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0299  ISGsu1, transposase  83.2 
 
 
1119 bp  163  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0957  ISGsu1, transposase  83.2 
 
 
1119 bp  163  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2180  ISGsu1, transposase  83.2 
 
 
1119 bp  163  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0252  ISGsu1, transposase  83.2 
 
 
1119 bp  163  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.423993  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2141  ISGsu1, transposase, interruption  86.13 
 
 
1089 bp  121  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2138  hypothetical protein  88.06 
 
 
129 bp  69.9  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.214556  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0986  putative transposase  88.89 
 
 
1131 bp  69.9  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3088    93.33 
 
 
1111 bp  65.9  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2370  transposase IS4 family protein  94.44 
 
 
1170 bp  56  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5422  IS4 family transposase  92.31 
 
 
1170 bp  54  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.219241  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0072    93.94 
 
 
1156 bp  50.1  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.319917  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1138  transposase, IS4  96.55 
 
 
1170 bp  50.1  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16162  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2223  transposase IS4  100 
 
 
1170 bp  48.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.285308  normal  0.571436 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>