14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3088 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3088    100 
 
 		 1111 bp  2202    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2344  transposase IS4 family protein  78.26 
 
 		 786 bp  77.8  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.718047  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0609    93.33 
 
 		 546 bp  65.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2646  transposase IS4 family protein  93.33 
 
 		 1119 bp  65.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2974  transposase IS4 family protein  93.33 
 
 		 939 bp  65.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0252  ISGsu1, transposase  92.5 
 
 		 1119 bp  56  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.423993  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0299  ISGsu1, transposase  92.5 
 
 		 1119 bp  56  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0957  ISGsu1, transposase  92.5 
 
 		 1119 bp  56  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2141  ISGsu1, transposase, interruption  92.5 
 
 		 1089 bp  56  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2180  ISGsu1, transposase  92.5 
 
 		 1119 bp  56  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0986  putative transposase  78.43 
 
 		 1131 bp  56  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5422  IS4 family transposase  94.44 
 
 		 1170 bp  56  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.219241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1138  transposase, IS4  90.48 
 
 		 1170 bp  52  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16162  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0140  transposase, IS4 family protein  89.13 
 
 		 1170 bp  52  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.745984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>