21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2417 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2417  hypothetical protein  100 
 
 
199 aa  391  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1836  hypothetical protein  50.76 
 
 
197 aa  154  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.301761  normal  0.446961 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2130  hypothetical protein  50 
 
 
195 aa  148  6e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2093  hypothetical protein  51.06 
 
 
199 aa  145  5e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.0050672  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3169  hypothetical protein  48.55 
 
 
198 aa  134  9e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1703  hypothetical protein  42.51 
 
 
210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.338855  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1401  hypothetical protein  36.5 
 
 
224 aa  108  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.89013  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18090  hypothetical protein  38.22 
 
 
244 aa  105  6e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.335902  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1332  hypothetical protein  42.25 
 
 
221 aa  104  7e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.386362  normal  0.4731 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0301  hypothetical protein  34.08 
 
 
199 aa  94.4  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0142  hypothetical protein  32.96 
 
 
199 aa  90.5  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2029  hypothetical protein  41.38 
 
 
209 aa  89.4  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0861085 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1413  hypothetical protein  45.05 
 
 
243 aa  87.8  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000075431 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01170  hypothetical protein  29.95 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14690  MarR family regulator  31.5 
 
 
205 aa  56.2  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547683  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15490  SatD  29.51 
 
 
206 aa  48.1  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.163286  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2287  hypothetical protein  24.19 
 
 
210 aa  45.8  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146223 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1008  hypothetical protein  26.11 
 
 
221 aa  45.4  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1080  hypothetical protein  25.41 
 
 
226 aa  44.7  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.796518  normal  0.575608 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12070  hypothetical protein  40.26 
 
 
217 aa  43.5  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0543745  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2659  hypothetical protein  29.25 
 
 
209 aa  42  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>