18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1836 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1836  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  366  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.301761  normal  0.446961 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1401  hypothetical protein  50.69 
 
 
224 aa  166  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.89013  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2417  hypothetical protein  50.76 
 
 
199 aa  157  7e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2130  hypothetical protein  54.59 
 
 
195 aa  151  5.9999999999999996e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1703  hypothetical protein  52.24 
 
 
210 aa  149  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.338855  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0301  hypothetical protein  44.2 
 
 
199 aa  144  6e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0142  hypothetical protein  44.2 
 
 
199 aa  144  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18090  hypothetical protein  44.62 
 
 
244 aa  132  3.9999999999999996e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.335902  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3169  hypothetical protein  47.46 
 
 
198 aa  131  7.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1332  hypothetical protein  44.39 
 
 
221 aa  128  6e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.386362  normal  0.4731 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1413  hypothetical protein  39.83 
 
 
243 aa  127  7.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000075431 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01170  hypothetical protein  45.41 
 
 
209 aa  116  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2029  hypothetical protein  45.1 
 
 
209 aa  97.1  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0861085 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2093  hypothetical protein  46.91 
 
 
199 aa  97.4  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.0050672  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14690  MarR family regulator  39.9 
 
 
205 aa  85.1  7e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547683  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15490  SatD  31.1 
 
 
206 aa  57  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.163286  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2212  hypothetical protein  28.34 
 
 
204 aa  42.4  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.734712  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1351  pyruvate phosphate dikinase  46.94 
 
 
877 aa  41.6  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.154627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>