16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1332 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1332  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  433  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.386362  normal  0.4731 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1401  hypothetical protein  44.95 
 
 
224 aa  141  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.89013  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1703  hypothetical protein  45.66 
 
 
210 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.338855  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0301  hypothetical protein  45.27 
 
 
199 aa  137  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0142  hypothetical protein  42.79 
 
 
199 aa  132  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1836  hypothetical protein  44.39 
 
 
197 aa  129  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.301761  normal  0.446961 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2130  hypothetical protein  40.28 
 
 
195 aa  112  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2417  hypothetical protein  42.25 
 
 
199 aa  111  7.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1413  hypothetical protein  38.11 
 
 
243 aa  111  9e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000075431 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18090  hypothetical protein  38.42 
 
 
244 aa  105  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.335902  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3169  hypothetical protein  35.56 
 
 
198 aa  98.6  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2093  hypothetical protein  38.97 
 
 
199 aa  77  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.0050672  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2029  hypothetical protein  38.64 
 
 
209 aa  71.2  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0861085 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01170  hypothetical protein  34.25 
 
 
209 aa  71.2  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14690  MarR family regulator  35.57 
 
 
205 aa  64.7  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547683  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12070  hypothetical protein  36.36 
 
 
217 aa  43.9  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0543745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>