16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1008 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1008  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  455  1e-127  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2659  hypothetical protein  29.76 
 
 
209 aa  102  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0981  satD protein  29.95 
 
 
228 aa  97.1  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2503  hypothetical protein  28.57 
 
 
216 aa  92.8  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.088721  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1974  hypothetical protein  25 
 
 
220 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.297418  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15490  SatD  26.06 
 
 
206 aa  60.1  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.163286  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24060  hypothetical protein  28.93 
 
 
213 aa  52  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.384658 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4687  hypothetical protein  27.49 
 
 
210 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597544  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4773  hypothetical protein  27.49 
 
 
210 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.571522  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5072  hypothetical protein  27.85 
 
 
210 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.805269 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11200  hypothetical protein  33.04 
 
 
212 aa  45.4  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2417  hypothetical protein  26.11 
 
 
199 aa  45.4  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1645  hypothetical protein  26.29 
 
 
216 aa  44.7  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2130  hypothetical protein  25.62 
 
 
195 aa  43.9  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18090  hypothetical protein  28.57 
 
 
244 aa  42.7  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.335902  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5125  hypothetical protein  24.54 
 
 
210 aa  41.6  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.303537 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>