14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5125 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5125  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  426  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1080  hypothetical protein  34.56 
 
 		 226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.796518  normal  0.575608 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2287  hypothetical protein  33.67 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146223 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2212  hypothetical protein  30.6 
 
 		 204 aa  86.7  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.734712  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0371  hypothetical protein  29.17 
 
 		 282 aa  81.3  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0291878 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1645  hypothetical protein  30.77 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09833  fumarate hydratase  25.45 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1766  hypothetical protein  30.73 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.19576  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01799  hypothetical protein  26.09 
 
 		 252 aa  72.4  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0129739  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1850  hypothetical protein  26.09 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.771027  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3042  hypothetical protein  29.95 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4168  hypothetical protein  29.31 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15490  SatD  24.21 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.163286  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1008  hypothetical protein  24.54 
 
 		 221 aa  41.6  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>