12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1766 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1766  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  431  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.19576  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01799  hypothetical protein  27.94 
 
 		 252 aa  97.8  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0129739  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5125  hypothetical protein  30.73 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1080  hypothetical protein  28.18 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.796518  normal  0.575608 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2287  hypothetical protein  27.27 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146223 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1645  hypothetical protein  29.05 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2212  hypothetical protein  24.19 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.734712  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09833  fumarate hydratase  23.77 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4168  hypothetical protein  30.89 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3042  hypothetical protein  26.63 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1850  hypothetical protein  25.91 
 
 		 216 aa  48.9  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.771027  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0371  hypothetical protein  26.55 
 
 		 282 aa  47  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0291878 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>