15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1080 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1080  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  459  9.999999999999999e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.796518  normal  0.575608 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09833  fumarate hydratase  31.76 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5125  hypothetical protein  34.56 
 
 		 210 aa  113  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2287  hypothetical protein  31.65 
 
 		 210 aa  84.7  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146223 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0371  hypothetical protein  32.96 
 
 		 282 aa  71.6  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0291878 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1766  hypothetical protein  28.18 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.19576  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2212  hypothetical protein  23.98 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.734712  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1850  hypothetical protein  28.64 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.771027  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15490  SatD  24.54 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.163286  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1645  hypothetical protein  28.04 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3042  hypothetical protein  24.53 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01799  hypothetical protein  29.25 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0129739  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4168  hypothetical protein  21.79 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2417  hypothetical protein  25.41 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3169  hypothetical protein  29.25 
 
 		 198 aa  42.4  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>