37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0662 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0662  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  238  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0174  Fis family transcriptional regulator  72.88 
 
 
102 aa  171  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.669693 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0733  Fis family transcriptional regulator  72.88 
 
 
102 aa  171  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.570468 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3730  hypothetical protein  75.42 
 
 
108 aa  168  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.834918  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10435  hypothetical protein  74.58 
 
 
102 aa  166  7e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0738239  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0570  hypothetical protein  72.03 
 
 
102 aa  161  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0560  Fis family transcriptional regulator  72.03 
 
 
102 aa  161  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.469059 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0582  Fis family transcriptional regulator  72.03 
 
 
102 aa  161  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.457081  hitchhiker  0.00711448 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0686  hypothetical protein  75.58 
 
 
106 aa  136  7e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.036269  hitchhiker  0.0000149472 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2943  hypothetical protein  76.14 
 
 
93 aa  135  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0814  hypothetical protein  73.49 
 
 
97 aa  130  6.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.102911 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0890  hypothetical protein  76.92 
 
 
117 aa  124  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31630  hypothetical protein  56.52 
 
 
124 aa  122  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.429871  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0775  hypothetical protein  74.36 
 
 
90 aa  120  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.752596  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0097  hypothetical protein  66.34 
 
 
103 aa  115  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4868  hypothetical protein  66 
 
 
101 aa  113  7.999999999999999e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34540  hypothetical protein  59.65 
 
 
104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.959194  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4210  hypothetical protein  63.74 
 
 
94 aa  103  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0776  hypothetical protein  59.09 
 
 
121 aa  100  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3638  hypothetical protein  75.41 
 
 
128 aa  99.8  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0428  hypothetical protein  69.7 
 
 
94 aa  99.8  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.199296  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0793  hypothetical protein  60.71 
 
 
105 aa  98.2  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0181  hypothetical protein  68.85 
 
 
221 aa  97.8  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.198242  normal  0.505027 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3991  hypothetical protein  72.84 
 
 
97 aa  94.4  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0223  hypothetical protein  58.43 
 
 
105 aa  94  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21820  hypothetical protein  60.53 
 
 
99 aa  93.6  7e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000000336981  normal  0.341827 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3305  hypothetical protein  62.32 
 
 
93 aa  93.6  9e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8925  hypothetical protein  56.79 
 
 
100 aa  92.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.667548  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0251  hypothetical protein  66.07 
 
 
145 aa  85.9  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0658656 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0290  hypothetical protein  55.56 
 
 
139 aa  84.7  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.191458 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8129  hypothetical protein  61.67 
 
 
113 aa  79.7  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4392  hypothetical protein  57.81 
 
 
117 aa  77.4  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.277341  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04070  hypothetical protein  51.35 
 
 
120 aa  73.6  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07590  hypothetical protein  55.07 
 
 
112 aa  70.1  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2059  hypothetical protein  40.3 
 
 
97 aa  53.9  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0877  hypothetical protein  51.16 
 
 
90 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09650  hypothetical protein  32.43 
 
 
90 aa  42  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.524526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>