36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4392 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4392  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  228  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.277341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2943  hypothetical protein  65.33 
 
 		 93 aa  100  8e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0662  hypothetical protein  52.53 
 
 		 118 aa  99.8  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0814  hypothetical protein  60.49 
 
 		 97 aa  99.8  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.102911 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31630  hypothetical protein  49.02 
 
 		 124 aa  98.6  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.429871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0775  hypothetical protein  55.56 
 
 		 90 aa  98.2  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.752596  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0181  hypothetical protein  73.33 
 
 		 221 aa  97.1  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.198242  normal  0.505027 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0686  hypothetical protein  57.83 
 
 		 106 aa  95.5  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.036269  hitchhiker  0.0000149472 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3730  hypothetical protein  57.33 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.834918  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0733  Fis family transcriptional regulator  53.16 
 
 		 102 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.570468 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0174  Fis family transcriptional regulator  53.16 
 
 		 102 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.669693 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0890  hypothetical protein  46.94 
 
 		 117 aa  88.6  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0097  hypothetical protein  64.06 
 
 		 103 aa  87  8e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0560  Fis family transcriptional regulator  52.44 
 
 		 102 aa  86.7  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.469059 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0582  Fis family transcriptional regulator  52.44 
 
 		 102 aa  86.7  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.457081  hitchhiker  0.00711448 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0570  hypothetical protein  52.44 
 
 		 102 aa  86.7  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21820  hypothetical protein  58.33 
 
 		 99 aa  86.3  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000000336981  normal  0.341827 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10435  hypothetical protein  53.85 
 
 		 102 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0738239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0251  hypothetical protein  60 
 
 		 145 aa  84.3  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0658656 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34540  hypothetical protein  50 
 
 		 104 aa  83.6  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.959194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0290  hypothetical protein  61.29 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.191458 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0793  hypothetical protein  62.5 
 
 		 105 aa  82.4  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8129  hypothetical protein  59.04 
 
 		 113 aa  80.9  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8925  hypothetical protein  54.43 
 
 		 100 aa  81.3  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.667548  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3305  hypothetical protein  62.71 
 
 		 93 aa  79.3  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3638  hypothetical protein  62.9 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0223  hypothetical protein  56.72 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0428  hypothetical protein  58.06 
 
 		 94 aa  77.4  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.199296  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04070  hypothetical protein  46.94 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3991  hypothetical protein  61.54 
 
 		 97 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4210  hypothetical protein  50 
 
 		 94 aa  74.3  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4868  hypothetical protein  60.53 
 
 		 101 aa  72.4  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0776  hypothetical protein  49.43 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07590  hypothetical protein  47.47 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0877  hypothetical protein  53.45 
 
 		 90 aa  60.1  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2059  hypothetical protein  39.74 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>