36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0223 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0223  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  212  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4210  hypothetical protein  78.65 
 
 		 94 aa  125  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0570  hypothetical protein  60.92 
 
 		 102 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0582  Fis family transcriptional regulator  60.92 
 
 		 102 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.457081  hitchhiker  0.00711448 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0560  Fis family transcriptional regulator  60.92 
 
 		 102 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.469059 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0686  hypothetical protein  66.67 
 
 		 106 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.036269  hitchhiker  0.0000149472 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0662  hypothetical protein  58.43 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2943  hypothetical protein  68.35 
 
 		 93 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3730  hypothetical protein  62.96 
 
 		 108 aa  110  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.834918  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10435  hypothetical protein  57.47 
 
 		 102 aa  110  6e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0738239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0814  hypothetical protein  65.43 
 
 		 97 aa  108  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.102911 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0174  Fis family transcriptional regulator  58.62 
 
 		 102 aa  107  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.669693 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0890  hypothetical protein  63.75 
 
 		 117 aa  107  7.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0733  Fis family transcriptional regulator  60.98 
 
 		 102 aa  106  8.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.570468 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0775  hypothetical protein  59.77 
 
 		 90 aa  103  8e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.752596  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31630  hypothetical protein  55.32 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.429871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34540  hypothetical protein  57.94 
 
 		 104 aa  100  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.959194  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3305  hypothetical protein  68.66 
 
 		 93 aa  100  8e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0097  hypothetical protein  69.51 
 
 		 103 aa  99.4  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4868  hypothetical protein  55 
 
 		 101 aa  94.4  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0793  hypothetical protein  61.45 
 
 		 105 aa  93.2  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3638  hypothetical protein  67.74 
 
 		 128 aa  91.3  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0428  hypothetical protein  59.15 
 
 		 94 aa  91.3  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.199296  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8925  hypothetical protein  59.21 
 
 		 100 aa  90.1  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.667548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0181  hypothetical protein  63.33 
 
 		 221 aa  88.2  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.198242  normal  0.505027 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0776  hypothetical protein  55.56 
 
 		 121 aa  87.8  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21820  hypothetical protein  54.05 
 
 		 99 aa  82  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000000336981  normal  0.341827 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3991  hypothetical protein  62.71 
 
 		 97 aa  78.6  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4392  hypothetical protein  57.58 
 
 		 117 aa  77.8  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.277341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0251  hypothetical protein  57.63 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0658656 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8129  hypothetical protein  55.38 
 
 		 113 aa  76.6  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0290  hypothetical protein  52.94 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.191458 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04070  hypothetical protein  38.14 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07590  hypothetical protein  44.19 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2059  hypothetical protein  34.52 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0877  hypothetical protein  44.83 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>