36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3638 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3638  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  250  4.0000000000000004e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0686  hypothetical protein  86.59 
 
 
106 aa  147  4e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.036269  hitchhiker  0.0000149472 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0814  hypothetical protein  80.25 
 
 
97 aa  135  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.102911 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2943  hypothetical protein  78.82 
 
 
93 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0560  Fis family transcriptional regulator  68.97 
 
 
102 aa  129  9e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.469059 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0582  Fis family transcriptional regulator  68.97 
 
 
102 aa  129  9e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.457081  hitchhiker  0.00711448 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0570  hypothetical protein  68.97 
 
 
102 aa  129  9e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10435  hypothetical protein  64.13 
 
 
102 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0738239  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31630  hypothetical protein  73.26 
 
 
124 aa  128  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.429871  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0662  hypothetical protein  74.39 
 
 
118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3730  hypothetical protein  71.95 
 
 
108 aa  128  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.834918  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0775  hypothetical protein  75.29 
 
 
90 aa  127  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.752596  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0890  hypothetical protein  79.49 
 
 
117 aa  127  6e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0733  Fis family transcriptional regulator  70.73 
 
 
102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.570468 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0174  Fis family transcriptional regulator  65.56 
 
 
102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.669693 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4868  hypothetical protein  64.65 
 
 
101 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0097  hypothetical protein  70.83 
 
 
103 aa  108  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0428  hypothetical protein  82.26 
 
 
94 aa  104  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.199296  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21820  hypothetical protein  64.47 
 
 
99 aa  98.6  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000000336981  normal  0.341827 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34540  hypothetical protein  69.14 
 
 
104 aa  97.8  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.959194  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0223  hypothetical protein  60.19 
 
 
105 aa  97.4  6e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8925  hypothetical protein  66.28 
 
 
100 aa  95.9  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.667548  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0793  hypothetical protein  73.44 
 
 
105 aa  94.7  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0181  hypothetical protein  70 
 
 
221 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.198242  normal  0.505027 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4210  hypothetical protein  58.51 
 
 
94 aa  92.8  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3991  hypothetical protein  72.13 
 
 
97 aa  89.4  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3305  hypothetical protein  69.49 
 
 
93 aa  87  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8129  hypothetical protein  66.67 
 
 
113 aa  85.1  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0776  hypothetical protein  60.76 
 
 
121 aa  81.3  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0251  hypothetical protein  62.07 
 
 
145 aa  80.9  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0658656 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4392  hypothetical protein  63.93 
 
 
117 aa  78.6  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.277341  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0290  hypothetical protein  60.71 
 
 
139 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.191458 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04070  hypothetical protein  56.92 
 
 
120 aa  73.9  0.0000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07590  hypothetical protein  47.37 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0877  hypothetical protein  55.42 
 
 
90 aa  67.8  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2059  hypothetical protein  35.06 
 
 
97 aa  51.6  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>