37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_07590 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_07590  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  217  5e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31630  hypothetical protein  45.74 
 
 
124 aa  76.3  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.429871  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0686  hypothetical protein  53.62 
 
 
106 aa  74.7  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.036269  hitchhiker  0.0000149472 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2943  hypothetical protein  53.42 
 
 
93 aa  72.4  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0097  hypothetical protein  50.75 
 
 
103 aa  70.9  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0662  hypothetical protein  55.07 
 
 
118 aa  70.1  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0181  hypothetical protein  55 
 
 
221 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.198242  normal  0.505027 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21820  hypothetical protein  53.85 
 
 
99 aa  68.6  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000000336981  normal  0.341827 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3730  hypothetical protein  52.86 
 
 
108 aa  68.2  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.834918  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0793  hypothetical protein  56.9 
 
 
105 aa  68.2  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0775  hypothetical protein  50 
 
 
90 aa  67.4  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.752596  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3638  hypothetical protein  46.51 
 
 
128 aa  67  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0814  hypothetical protein  52.94 
 
 
97 aa  66.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.102911 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8129  hypothetical protein  55.93 
 
 
113 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34540  hypothetical protein  44 
 
 
104 aa  63.9  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.959194  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04070  hypothetical protein  45.05 
 
 
120 aa  63.9  0.0000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0890  hypothetical protein  50.75 
 
 
117 aa  63.9  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0251  hypothetical protein  49.33 
 
 
145 aa  63.5  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0658656 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2059  hypothetical protein  43.18 
 
 
97 aa  63.5  0.0000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0733  Fis family transcriptional regulator  49.28 
 
 
102 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.570468 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0174  Fis family transcriptional regulator  49.28 
 
 
102 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.669693 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10435  hypothetical protein  43.75 
 
 
102 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0738239  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3991  hypothetical protein  54.55 
 
 
97 aa  62  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0582  Fis family transcriptional regulator  46.75 
 
 
102 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.457081  hitchhiker  0.00711448 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0560  Fis family transcriptional regulator  46.75 
 
 
102 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.469059 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0570  hypothetical protein  46.75 
 
 
102 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4210  hypothetical protein  42.86 
 
 
94 aa  60.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0290  hypothetical protein  47.06 
 
 
139 aa  60.8  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.191458 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0776  hypothetical protein  44.83 
 
 
121 aa  60.5  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4392  hypothetical protein  55 
 
 
117 aa  60.5  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.277341  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0223  hypothetical protein  41.98 
 
 
105 aa  59.7  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3305  hypothetical protein  48.57 
 
 
93 aa  57.4  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0428  hypothetical protein  47.46 
 
 
94 aa  55.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.199296  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4868  hypothetical protein  50.91 
 
 
101 aa  55.1  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8925  hypothetical protein  44.44 
 
 
100 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.667548  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09650  hypothetical protein  35.37 
 
 
90 aa  44.7  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.524526  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0877  hypothetical protein  40.68 
 
 
90 aa  45.1  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>