22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3801 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3801  CopG domain protein DNA-binding domain protein  100 
 
 		 59 aa  117  7e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3884  CopG domain protein DNA-binding domain protein  96.61 
 
 		 59 aa  114  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4175  CopG/DNA-binding domain-containing protein  75.41 
 
 		 61 aa  91.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0217937  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3364  hypothetical protein  70.97 
 
 		 101 aa  83.6  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0056  CopG-like DNA-binding protein  69.84 
 
 		 63 aa  82  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0468  hypothetical protein  79.55 
 
 		 60 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.243553  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1587  hypothetical protein  63.83 
 
 		 71 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0040985  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0898  CopG/DNA-binding domain-containing protein  57.41 
 
 		 74 aa  61.6  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000639023  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0157  hypothetical protein  50 
 
 		 58 aa  51.2  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1042  CopG domain protein DNA-binding domain protein  50 
 
 		 53 aa  50.4  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.118983 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0531  hypothetical protein  41.38 
 
 		 58 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2417  hypothetical protein  47.06 
 
 		 64 aa  47.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3221  CopG domain protein DNA-binding domain protein  47.83 
 
 		 54 aa  47.4  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.436517  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1569  CopG family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.684865  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0787  CopG/DNA-binding domain-containing protein  50 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000109224  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3659  CopG/DNA-binding domain-containing protein  46.67 
 
 		 73 aa  45.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1356  hypothetical protein  47.73 
 
 		 62 aa  44.3  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.275188  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2937  CopG domain protein DNA-binding domain protein  39.29 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2929  hypothetical protein  43.4 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1285  CopG domain protein DNA-binding domain protein  42.86 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.81302e-17 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3362  hypothetical protein  36.36 
 
 		 52 aa  40.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000002572  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0797  hypothetical protein  45.95 
 
 		 141 aa  40  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>