22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4175 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4175  CopG/DNA-binding domain-containing protein  100 
 
 		 61 aa  120  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0217937  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3801  CopG domain protein DNA-binding domain protein  75.41 
 
 		 59 aa  91.7  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3884  CopG domain protein DNA-binding domain protein  75.41 
 
 		 59 aa  90.1  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0056  CopG-like DNA-binding protein  66.67 
 
 		 63 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3364  hypothetical protein  74.51 
 
 		 101 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0468  hypothetical protein  81.82 
 
 		 60 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.243553  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1587  hypothetical protein  59.57 
 
 		 71 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0040985  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0898  CopG/DNA-binding domain-containing protein  59.18 
 
 		 74 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000639023  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0531  hypothetical protein  41.38 
 
 		 58 aa  60.5  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1042  CopG domain protein DNA-binding domain protein  56.82 
 
 		 53 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.118983 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0157  hypothetical protein  50 
 
 		 58 aa  55.1  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3221  CopG domain protein DNA-binding domain protein  52.38 
 
 		 54 aa  51.6  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.436517  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1569  CopG family transcriptional regulator  50 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.684865  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2417  hypothetical protein  42.31 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0787  CopG/DNA-binding domain-containing protein  55.56 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000109224  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1356  hypothetical protein  40.91 
 
 		 62 aa  44.7  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.275188  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2937  CopG domain protein DNA-binding domain protein  37.31 
 
 		 91 aa  44.7  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3659  CopG/DNA-binding domain-containing protein  50 
 
 		 73 aa  43.9  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2929  hypothetical protein  40.91 
 
 		 62 aa  43.9  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3362  hypothetical protein  36.36 
 
 		 52 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000002572  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0797  hypothetical protein  48.65 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1285  CopG domain protein DNA-binding domain protein  41.18 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.81302e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>