22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3364 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3364  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  213  8e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0056  CopG-like DNA-binding protein  84.13 
 
 		 63 aa  105  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3801  CopG domain protein DNA-binding domain protein  70.97 
 
 		 59 aa  83.6  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3884  CopG domain protein DNA-binding domain protein  72.58 
 
 		 59 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0468  hypothetical protein  71.15 
 
 		 60 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.243553  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4175  CopG/DNA-binding domain-containing protein  74.51 
 
 		 61 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0217937  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1587  hypothetical protein  64.44 
 
 		 71 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0040985  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0898  CopG/DNA-binding domain-containing protein  58.82 
 
 		 74 aa  62  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000639023  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0157  hypothetical protein  48.08 
 
 		 58 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0531  hypothetical protein  40 
 
 		 58 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1356  hypothetical protein  47.06 
 
 		 62 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.275188  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2929  hypothetical protein  47.06 
 
 		 62 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0787  CopG/DNA-binding domain-containing protein  41.82 
 
 		 101 aa  47.4  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000109224  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1569  CopG family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 71 aa  47  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.684865  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1042  CopG domain protein DNA-binding domain protein  47.73 
 
 		 53 aa  46.2  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.118983 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2937  CopG domain protein DNA-binding domain protein  38.98 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1285  CopG domain protein DNA-binding domain protein  38.24 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.81302e-17 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3659  CopG/DNA-binding domain-containing protein  47.5 
 
 		 73 aa  44.3  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3221  CopG domain protein DNA-binding domain protein  42.86 
 
 		 54 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.436517  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2417  hypothetical protein  39.62 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3362  hypothetical protein  38.64 
 
 		 52 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000002572  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1047  CopG-like DNA-binding protein  42.55 
 
 		 74 aa  40.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0338032  hitchhiker  0.0000136097 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>