16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3447 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3447  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  222  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3513  hypothetical protein  90.27 
 
 		 113 aa  202  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000049357 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3197  hypothetical protein  59.22 
 
 		 90 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910458  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3201  hypothetical protein  49.53 
 
 		 83 aa  95.9  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2577  hypothetical protein  50.91 
 
 		 95 aa  94.7  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2578  hypothetical protein  45.45 
 
 		 84 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1637  hypothetical protein  43.93 
 
 		 83 aa  77  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000527692  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3204  hypothetical protein  46.73 
 
 		 82 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1319  hypothetical protein  40.95 
 
 		 91 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3208  hypothetical protein  37.14 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3198  hypothetical protein  38.2 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1323  hypothetical protein  50 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2609  hypothetical protein  33.04 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1215  hypothetical protein  35.59 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.13658  normal  0.0940233 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0505  syntaxin domain-containing protein  36.36 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0045527 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2616  hypothetical protein  32.05 
 
 		 188 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.145924  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>