15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2578 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2578  hypothetical protein  100 
 
 
84 aa  168  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1637  hypothetical protein  90.36 
 
 
83 aa  155  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000527692  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2577  hypothetical protein  82.11 
 
 
95 aa  151  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3204  hypothetical protein  78.05 
 
 
82 aa  131  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3201  hypothetical protein  59.76 
 
 
83 aa  99.4  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3197  hypothetical protein  54.74 
 
 
90 aa  86.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910458  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3513  hypothetical protein  43.59 
 
 
113 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000049357 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3447  hypothetical protein  45.45 
 
 
113 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1323  hypothetical protein  76.09 
 
 
74 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1319  hypothetical protein  45 
 
 
91 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3198  hypothetical protein  41.1 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3208  hypothetical protein  41.1 
 
 
110 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2609  hypothetical protein  39.44 
 
 
131 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3255  hypothetical protein  33.33 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000708986  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3256  kid repeat protein  41.27 
 
 
100 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000812616  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>