19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3513 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3513  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  223  6e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000049357 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3447  hypothetical protein  90.27 
 
 
113 aa  202  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3197  hypothetical protein  61.17 
 
 
90 aa  120  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910458  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2577  hypothetical protein  48.72 
 
 
95 aa  97.4  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3201  hypothetical protein  48.6 
 
 
83 aa  92  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2578  hypothetical protein  43.59 
 
 
84 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1637  hypothetical protein  45.79 
 
 
83 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000527692  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3204  hypothetical protein  44.86 
 
 
82 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1319  hypothetical protein  41.9 
 
 
91 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3208  hypothetical protein  37.14 
 
 
110 aa  61.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3198  hypothetical protein  38.2 
 
 
95 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1323  hypothetical protein  51.92 
 
 
74 aa  51.2  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2609  hypothetical protein  33 
 
 
131 aa  47.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2616  hypothetical protein  34.62 
 
 
188 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.145924  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3500  hypothetical protein  33.33 
 
 
199 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3255  hypothetical protein  32.32 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000708986  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0521  hypothetical protein  32.95 
 
 
179 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1887  syntaxin domain-containing protein  37.68 
 
 
172 aa  42  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.546042 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1752  RepA / Rep+ protein KID  30.77 
 
 
187 aa  40  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000570014  normal  0.986546 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>