9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2774 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2774  rubrerythrin  100 
 
 		 163 aa  333  7.999999999999999e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0741161  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1466  rubrerythrin  90.68 
 
 		 161 aa  304  3e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.592561 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1095  rubrerythrin  35.81 
 
 		 160 aa  95.9  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0008947 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1973  hypothetical protein  36.62 
 
 		 345 aa  95.5  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.311913  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2081  hypothetical protein  36.05 
 
 		 154 aa  95.5  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0707  rubrerythrin  32.81 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2573e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0696  rubrerythrin  33.59 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.240604  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0435  hypothetical protein  30.82 
 
 		 162 aa  63.9  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000392041  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3003  hypothetical protein  28.26 
 
 		 171 aa  43.9  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>