10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1973 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1973  hypothetical protein  100 
 
 
345 aa  716    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.311913  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2081  hypothetical protein  38.13 
 
 
154 aa  99  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2774  rubrerythrin  36.62 
 
 
163 aa  95.5  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0741161  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1466  rubrerythrin  36.23 
 
 
161 aa  93.6  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.592561 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1095  rubrerythrin  33.1 
 
 
160 aa  90.9  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0008947 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0696  rubrerythrin  32.31 
 
 
157 aa  65.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.240604  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0707  rubrerythrin  31.82 
 
 
157 aa  63.9  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2573e-24 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0435  hypothetical protein  27.33 
 
 
162 aa  59.3  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000392041  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1116  hypothetical protein  24.6 
 
 
151 aa  47.8  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1088  hypothetical protein  25 
 
 
151 aa  44.3  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>